Laparoskopi ile karın içinde overler (yumurtalıklar) ile uterus (rahim) gözleniyor. Sol yumurtalıkta çikolata kisti (endometrioma) görülüyor. Kist patlatılınca gerçekten kistin içinden erimiş çikolata kıvamında ve renginde bir sıvı akıyor. Daha sonra yumurtalık üzerindeki kesi büyültülüyor ve çikolata kistini oluşturan kistin kapsülü soyularak yumurtalıktan çıkarılıyor ve batın dışına alınıyor. Daha sonra yumurtalıklar ve rahim serum ile yıkanıyor ve işleme son veriliyor.